Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms