Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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IFT27Q9BW83 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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IFT27Q9BW83 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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IFT27Q9BW83 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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IFT27Q9BW83 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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IFT27Q9BW83 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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