Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNPPD1Q9BV87 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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