Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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