Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOXF2Q9BQY4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms