Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms