Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGIP1Q9BQI5 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms