Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR78-202ENST00000371023 1697 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 COPS4-202ENST00000503682 1702 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01837-205ENST00000635947 1557 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC3-AS1-207ENST00000642113 2043 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNB1IP1-203ENST00000398160 1613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004158.1-202ENST00000624327 1645 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFB2-AS1-201ENST00000414452 557 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ADORA2BP1-201ENST00000429195 842 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108039.1-201ENST00000456719 609 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008667.3-201ENST00000506892 553 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYAB-215ENST00000533971 981 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms