Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRPF18Q99633 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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