Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSPAN18Q96SJ8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms