Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS6KC1Q96S38 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms