Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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