Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINGO1Q96FE5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINGO1Q96FE5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms