Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms