Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUB2Q96DC9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms