Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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