Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHMTQ93088 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms