Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF516Q92618 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms