Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN4Q92575 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms