Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM3CQ92520 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM3CQ92520 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms