Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms