Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RASGEF1AQ8N9B8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms