Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms