Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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HERC6Q8IVU3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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HERC6Q8IVU3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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HERC6Q8IVU3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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HERC6Q8IVU3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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HERC6Q8IVU3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC6Q8IVU3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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