Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKAP1Q86WV1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms