Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNE3Q6ZMZ3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms