Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD4L3Q6VB84 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms