Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C16orf54Q6UWD8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms