Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms