Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRIP1Q5VSL9 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms