Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PXDC1Q5TGL8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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