Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LGSNQ5TDP6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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