Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms