Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FHOD3Q2V2M9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FHOD3Q2V2M9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms