Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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