Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FXNQ16595 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FXNQ16595 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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