Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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