Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ZFHX3Q15911 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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