Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP13Q15645 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP13Q15645 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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