Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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TAF1AQ15573 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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