Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms