Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCP1Q15431 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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