Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TLR1Q15399 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TLR1Q15399 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TLR1Q15399 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TLR1Q15399 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms