Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE3CQ15386 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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