Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRKQ15262 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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