Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PTPRRQ15256 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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