Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCM1Q15154 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms