Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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