Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIN2CQ14957 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms