Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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